服務(wù)簡(jiǎn)介
單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)，即染色體基因組中單個(gè)核苷酸的突變而引起的 DNA 序列的多態(tài)性，它以單個(gè)堿基的顛換、轉(zhuǎn)換、插入和缺失等形式存在。從理論上來(lái)看每一個(gè)SNP 位點(diǎn)都可以有4 種不同的變異形式,但實(shí)際上發(fā)生的只有兩種，即轉(zhuǎn)換和顛換,二者之比為2：1。SNP 在CG序列上出現(xiàn)較為頻繁，而且多是C轉(zhuǎn)換為T，原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化,而后自發(fā)地脫氨成為胸腺嘧啶。一般而言，SNP 是指變異頻率大于1 %的單核苷酸變異。在人類(lèi)基因組中大概每1000 個(gè)堿基就有一個(gè)SNP，人類(lèi)基因組上的SNP總量大概是3×10^6個(gè)。因此，SNP成為遺傳標(biāo)志，人體許多表型差異、對(duì)藥物或疾病的易感性等等都可能與SNP有關(guān)。
SNP研究是人類(lèi)基因組計(jì)劃走向應(yīng)用的重要步驟。大量存在的SNP位點(diǎn)，使人們有機(jī)會(huì)發(fā)現(xiàn)與各種疾病，包括腫瘤相關(guān)的基因組突變。研究發(fā)現(xiàn)，人體許多表型差異、對(duì)藥物或疾病的易感性等等都與SNP有關(guān)。
基于過(guò)硬的引物合成及標(biāo)記技術(shù)，多重PCR擴(kuò)增技術(shù)，測(cè)序技術(shù)，本公司推出多種SNP分型服務(wù)的方法：直接測(cè)序方法、多重SNaPshot SNP方法、以及Taqman探針設(shè)計(jì)合成，為廣大客戶(hù)提供多樣的選擇。涵蓋了對(duì)血液、組織、口腔、細(xì)菌、真菌樣品gRNA提取及分型技術(shù)服務(wù)。
常用方法
1 直接測(cè)序法
技術(shù)原理：將待檢測(cè)片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增并直接測(cè)序，是SNP檢測(cè)方法中準(zhǔn)確的方法。純合位點(diǎn)為單峰，而雜合峰為套峰，因而很容易將幾種基因型區(qū)分開(kāi)來(lái)。直接測(cè)序法不僅可用于對(duì)已知位點(diǎn)的檢測(cè)，還可用于發(fā)現(xiàn)未知的SNP位點(diǎn)。
2 KASP分型法
技術(shù)原理：KASP（Kompetitive Allele Specific PCR，競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR）只需要設(shè)計(jì)并合成普通擴(kuò)增引物，并利用分別帶有FAM、HEX或BHQ1修飾的通用探針引物即可實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的檢測(cè)。該方法不僅可以檢測(cè)SNP多態(tài)性位點(diǎn)，對(duì)插入缺失和特定的基因組中甲基胞嘧啶都可以實(shí)現(xiàn)檢測(cè)。該方法不僅縮短了基因多態(tài)性檢測(cè)周期，同時(shí)也大大降低了檢測(cè)成本。
3 連接酶檢測(cè)反應(yīng)（LDR）分型方法
技術(shù)原理：主要應(yīng)用連接酶檢測(cè)反應(yīng)（（igase detection reaction，LDR）技術(shù)。即在Taq DNA連接酶的作用下，當(dāng)左右兩條索核苷酸探針與目的DNA序列完全互補(bǔ)，并且兩條探針之間沒(méi)有空障時(shí)才能發(fā)生連接反應(yīng)，否則連接反應(yīng)不能進(jìn)行，通過(guò)熒光掃描片段長(zhǎng)度，實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP位點(diǎn)的檢測(cè)。
4 多重SNaPshot SNP分型方法
技術(shù)原理：SNaPshot SNP分型是一種以單堿基延神原理為基礎(chǔ)，同時(shí)利用多重PCR對(duì)多個(gè)已知SNP位點(diǎn)進(jìn)行遺傳分型的方法。在一個(gè)含有測(cè)序酶，四種熒光標(biāo)記的ddNTP，緊挨多態(tài)位點(diǎn)5'端的不同長(zhǎng)度延伸引物和PCR產(chǎn)物模板的反應(yīng)體系中，引物延伸一個(gè)堿基即終止，經(jīng)測(cè)序儀跑膠后，根據(jù)峰的顏色可知摻入的堿基種類(lèi)，從而確定該樣本的基因型，根據(jù)峰移動(dòng)的膠位置確定該延伸產(chǎn)物對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn)。
5 Taqman 探針?lè)椒?/span>
技術(shù)原理：在PCR反應(yīng)系統(tǒng)中加入2種不同熒光標(biāo)記的探針，它們可分別與2個(gè)等位基因完全配對(duì)。正常情況下，由于探針5'端熒光基團(tuán)和3端淬滅基團(tuán)緊鄰在一起，熒光被淬滅。隨著PCR的有效進(jìn)行，與模板完全配對(duì)的探針逐步被Taq DNA聚合酶5'-→3'外切酵活性切割，致使探針5端上的熒光基團(tuán)與3'端的淬滅基團(tuán)分離，淬滅效應(yīng)解除，報(bào)告熒光基團(tuán)被激活；而與模板不能完全配對(duì)的探針（代表另一種等位基因）不能被有效切割，故檢不到熒光信號(hào)，通過(guò)相應(yīng)儀器檢測(cè)熒光值的變化即可實(shí)現(xiàn)SNP位點(diǎn)檢測(cè)。
應(yīng)用領(lǐng)域
l 表型變異/疾病遺傳機(jī)制研究
l 復(fù)雜疾病易感基因定位
l 基因檢測(cè)
l 個(gè)體化治療
l 特定人群的遺傳分析，人群進(jìn)化史研究
服務(wù)優(yōu)勢(shì)
百歐泰團(tuán)隊(duì)具有成熟檢測(cè)經(jīng)驗(yàn)，可提供多種服務(wù)優(yōu)勢(shì)：
l 分型準(zhǔn)確，其準(zhǔn)確度達(dá)99.9%；
l 可多位點(diǎn)同時(shí)檢測(cè)；
l 不受SNP位點(diǎn)多態(tài)特性限制；
l 不受樣品個(gè)數(shù)的限制；
l 專(zhuān)業(yè)性強(qiáng)：可根據(jù)客戶(hù)實(shí)驗(yàn)具體分析，滿(mǎn)足不同的實(shí)驗(yàn)需求，提供多種文庫(kù)構(gòu)建服務(wù)；
l 專(zhuān)業(yè)的技術(shù)支持，保障強(qiáng)力、周到的售前售后服務(wù)支持，隨時(shí)為您解答出現(xiàn)的任何問(wèn)題。
服務(wù)流程
雙方溝通一致后確定實(shí)驗(yàn)方案，確定服務(wù)要求-簽訂合同—預(yù)付款-開(kāi)始實(shí)驗(yàn)-成果交付
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